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침습 편평 세포암 (invasive squamous cell carcinoma) 은 [[결막 상피내 신생물]]보다 발생 빈도가 훨씬 낮으며 결막 상피내 신생물처럼 HPV가 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있다. 침습 편평상피세포암의 흔한 전구인자는 결막 상피내 신생물이며, 이형성 상피세포가 바닥막을 뚫고 결막하 공간 전체로 쉽게 퍼져나가는 경우에 발생한다. 이러한 침윤은 각막에서는 보우만층의 저항 때문에 일어나지 않고 결막 내에서만 일어난다. 임상적으로 [[결막 상피내 신생물]]과 닮았으나 좀 더 융기되어 보인다.
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